燕王假太祖遗诏，篡得帝位，去建文年号，以洪武三十五年为纪，以明年为永乐元年，建文更改成法一如旧制，榜齐泰、黄子澄、练子宁等五十余位建文朝臣为奸臣，诏告天下，檄文遍行全国，各地纷纷归附新帝。齐泰、黄子澄、练子宁等先后被执，押解入京。被执押解入京的还有徐辉祖。当日徐辉祖带领十余骑保护着假扮建文帝的溥洽，于朱高燧带领的燕兵阵中挑开一条血路，往东南方向疾驰而去，朱高燧回过神来，急令骑兵队追之，自领大军随后跟进。徐辉祖一行疾驰中见后面有骑兵队紧追不舍，知已无法摆脱，徐辉祖见前面不远处有一条河，河上有一石桥，桥头宽阔，适合阻击，徐辉祖命溥洽单骑过桥，他和十余骑桥头处回身一字摆开，等待追兵。朱高燧的骑兵队领将叫思脱突兀哈，骑着一匹灰色纯种蒙古马，拿了一柄雪亮弯月淬钢刀，此人是洪武二十三年燕王朱棣北征北元太尉乃儿不花时随乃儿不花投降的元骑兵大将，因武功了得，燕王便派给三儿子作武功师傅，他见乔装成建文帝的溥洽单骑过了桥，知本是为追建文帝而来，便拍马舞刀，直冲徐辉祖杀来，徐辉祖挺抢接住，和那思脱突兀哈厮杀一处，另有十余骑燕将，亦纵马向前和徐辉祖带领的十余骑捉对厮杀。桥头虽宽，但桥口太窄，只容得单骑通过，有徐辉祖带领的十余骑挡住桥口，其余燕军不得通过，燕军骑兵只得押住阵脚，看那十余对捉对儿的厮杀。桥头处刀光剑影，人晃马嘶，连战五十余回，彼此不分胜负，燕王三儿子朱高燧带了后军赶来，见徐辉祖所领十余骑枪法纯熟，毫无破绽，就算再战三百回合，也是不分胜负，听骑兵将领说‘建文帝’已单骑过桥而去，朱高燧气急的道：“有亲舅爷挡道，毁我立不世之功，如之奈何？”有谋士郭资献计曰：“可用精于射箭的弓弩手将南军士兵射杀，徐辉祖易擒，桥可过也。”郭资乃洪武三十一年七月燕王反时的北平参政，颇具谋略，燕王派他协助朱高燧镇守永平。朱高燧调来十余最强弓弩手，徐徐靠近厮杀的南军士兵，瞄准时机，纷纷出箭，南军士兵先后中箭落地，被与之缠斗的燕军骑将枭首，十余燕军骑将围了徐辉祖走马灯似的厮杀，徐辉祖人困马乏，加之大腿处的枪伤还没有痊愈，终因体力不支，闯下马来，被一拥而上的燕兵捆了，朱高燧领兵过桥，方圆几十里的搜寻，终是不见建文帝的踪迹，又有燕师破了京城，燕王已于南京称帝的消息接踵而来，朱高燧只得押了徐辉祖南京邀功去了。
时济南铁弦未下，盛庸不知所踪。永乐皇帝令大将朱能领兵往济南攻铁弦，令大将李远带兵寻盛庸收捕之。对齐泰、黄子澄、练子宁、胡闰等建文朝臣大开杀戮。灭齐泰九族，计六百二十三人，籍没外戚戍边者两千余人；灭黄子澄九族，计五百六十五人，籍没外戚戍边者两千余人；灭练子宁九族，计三百一十八人，籍没外戚戍边者千余人；灭胡闰九族，计二百七十人，籍没外戚戍边者千余人；惨遭灭族的还有高翔、王度、茅大芳、廖升、黄岩、王叔英、卓敬、陈迪、周是修等数十位建文朝臣，累计屠戮万余人，籍没戍边者数万人。时有景清者，不但惨遭灭族，还祸及乡里，被杀的家乡人十室九空，有《景清传》为证，传曰：“建文初，为北平参议，燕王与语，言论明晰，大称赏。再迁御史大夫。燕师入，诸臣死者甚众，清素预密谋，且约孝孺等同殉国，至是诣阙自归，成祖命仍其官。委蛇班行者久之，一日早朝，清衣绯怀刃入。先是，日者奏：‘异星赤色，犯帝座甚急。’成祖故疑清，及朝，清独着绯，命搜之，得所藏刀，诘责，清奋起曰：‘欲为故主报仇耳！’成祖怒，磔死，族之，籍其乡，转相攀染，谓之瓜蔓抄，村里为墟。”不但灭人九族，还‘转相攀染’瓜蔓抄，杀的‘村里为墟’。杀戮之惨，古未闻之有也。唯徐辉祖不屈，永乐皇帝不敢灭其族，徐辉祖乃永乐皇帝朱棣之大舅子，又是开国第一功臣魏国公徐达长子，灭徐辉祖九族，得有多少皇亲国戚被杀，就连永乐皇帝朱棣也在徐辉祖的九族之中，无奈永乐皇帝朱棣只得将徐辉祖削爵禁锢，命他在家里写悔过书。
李远知那日盛庸突围东去，出兵前派了数十哨探往东打听，有探马回报说太湖之滨的一个沙丘的芦苇丛里有一支军队驻扎，李远带了两千轻骑星夜驰往，见太湖之滨有一个突入太湖的大沙丘，三面环水，一面临陆，沙丘上芦苇正茂，在沙丘的芦苇丛中隐隐的有数十个帐篷，不见任何旗号，却有战马嘶鸣，李远知是盛庸所领的两千余骑兵驻扎于此，盛庸所领骑兵虽然只有两千余骑，但李远知道其战力非凡，为防盛庸再次突围走脱，李远调来五千步兵驻防于沙丘陆地入口，多设陷阱弓弩，又调来一万水军将沙丘临水的三面围住，然后单人划了小船去沙丘芦苇丛的帐篷里见了盛庸，李远道：“建文自焚，永乐登基，将军何不和众将士放下武器？免生灵再遭涂炭！”盛庸道：“燕王无辜之人尚且杀之，我等曾斩燕将、杀燕卒，燕王如何能容？”李远道：“将军所虑是也，我亲往面见陛下，为将军与众将士求得赦免手谕，将军再领众将士归降如何？”盛庸抱拳向李远道：“盛庸代众将士向将军致谢！”李远快骑入南京，面见了永乐皇帝，具言盛庸等人的担忧，