两日后，三人终于进了南京城。李邦华等人惊讶的发现，整个南京城几乎成了的大工地，到处都在建房修屋。
“战争的破坏实在是太大了，繁华的南京城竟然成了这副模样，也不知道秦淮河一带变成了什么样子？”宋应星叹道。
数年前他去北京赶考时经过南京城，在秦淮河游玩了数日，很是喜欢南京城的繁华风流。现在来南京城当官，估计至少要在南京城待上几年，可不希望南京城也变得像扬州那样。
“看来宋大人不仅喜欢研究机械，还喜欢研究风月啊。”田尔耕调侃道。一路相伴而行，二人已经建立了很好交情，算得上是无话不谈的朋友了。
“鱼我所欲也，熊掌亦我所欲也。”宋应星笑道。
“宋大人既然担任了南京工部尚书，这些事情以后就要归你负责了。”一旁的李邦华淡淡道。
修房修路，本就是工部负责的范围。南京城现在进行的这么大的工程，自然要由宋应星这个工部尚书负责。
“恐怕宋大人以后没时间去秦淮河游玩了啊。”田尔耕笑道。
宋应星顿时苦起脸来。
三位尚书同时来到南京报道，自然早就惊动了当今皇帝。还未等三人先到驿馆安置好，便有太监前来传达皇帝召见旨意。三人自然不敢怠慢，赶紧随着来传的小太监向行宫而去。
“这不是去皇宫的路吧？”李邦华突然问道。李邦华曾在南京任过职，对南京城道路非常熟悉。
“南京皇宫太过破败，眼下正在整修，还没法居住，陛下暂时住在以前的魏国公府。”眼前的三个都是部堂级大员，小太监不敢怠慢，恭敬的答道。
李邦华没再吭声，露出若有所思的表情。南京皇宫已经两百年没人居住了，破败是必然的事，但是皇帝只是南巡来此，说不定等不到皇宫修好就返回北京了，根本没必要进行整修。可现在皇帝却下令整修皇宫，而且是在大战刚刚结束江西还未平定的情况下，不惜耗费钱财民力整修皇宫，着实不是好的时机。
皇帝为何非要现在修缮皇宫？李邦华仔细想去，恐怕只有迁都这一个原因了。细极思恐，想想都让人感到震惊。
“二位大人先等一下。”寝宫外，田尔耕、宋应星二人被太监伸手拦住，二人相视一眼，默默的停下脚步。
“臣李邦华叩见陛下。”李邦华走进寝宫，向着皇帝行一跪三叩之礼。
“朕调李尚书来南京，并非是要闲置，而是有重要任务交给你。”让李邦华平身之后，朱由检开门见山道。
“不知陛下让臣做什么？”李邦华暗道果不其然。事实上一开始李邦华就有所怀疑，在一般人看来，朱由检把他调到南京任吏部尚书绝对是明升暗降，李邦华却不这么认为，而是猜测朱由检另有其他意图。
朱由检说：“李尚书想必已经听说过了，朕在江东四府进行了均田，并且在县下又设了镇村两级官府。接下来又要在江南各府乃至整个南直隶进行均田改制，等到彻底平定江西反贼之后，同样会在江西均田改制。朕决定，把已经完成均田的府县官员任免惩处之权，都交给南京吏部负责。”
李邦华倒吸了口凉气，把所有均田地区官吏任免权都交给南吏部负责，虽然现在只是在江东山东少数地区进行了均田，但看朱由检的意思，将来肯定是要在整个大明进行均田的。也就是说将来南京吏部要负责全国官员任免升迁罢黜。这是要用南京吏部取代北京吏部啊！
“陛下这样做，置北京吏部于何地？”李邦华声音颤抖道。此刻他并没有因为得到重任而惊喜，而是感到极大的不安。
“北京吏部负责没有进行均田省份官员任免，以后等到整个大明进行均田之后，都城自然会迁到南京，北京朝廷将会被取消，北京吏部自然会被南京吏部所取代。”朱由检毫不掩饰的说道。
迁都，由南京六部代替北京朝廷，朱由检的话让李邦华终于证实了自己的猜测。
“陛下，以北京为都城乃是成祖之命，为的是守卫边疆。陛下要把都城迁回南京，边防怎么办？北方百姓怎么办？”李邦华劝谏道。
“你先前一直任兵部侍郎，对现在局势应该清楚。眼下建奴已经被打残，漠南蒙古也已经降伏。边疆以后不会再有大的战事。大明的菁华之地在江南，把都城放在北京，上百万人口，九边重镇，都需要江南供养，每年光是粮食物质运输便耗费无数。而以南京为都城，则可势控整个大明！要比北京强得多。”朱由检解释道。
李邦华沉默了，他自然知道朱由检说的有道理，从经济角度来说，南京自然比北京更适合作为都城。可是......
“陛下，都城在北京，每年大量的物质从江南运往北方，维持着南北的平衡，若是迁都回南京的话，臣恐北方会越发的贫困，更恐九边将士感到被抛弃，从而无法安然守卫边疆。”李邦华叹道。
“南北经济差异，自然需要朝廷想法进行平衡。可在税收等方面进行调节。至于你说的边防问题，朕已经深思过。按照现在的情形，不管是蒙古人还是女真人，以后都不可能是大明的威胁。”朱由检道。
“陛下何以如此笃定？”李邦华