李靖说道：“陛下，当初臣曾提醒过您，侯君集有反心，但是您爱惜他的才华，不忍放弃他，可是又不对他加以约束，
终于导致他矜功自伐，恃宠而骄，闯下杀身之祸，臣认为陛下也负有连带责任，所以侯君集断然不能特赦。”
江夏王李道宗也说道：“侯君集这个人志大才疏，目中无人，自以为为国家流过血立过功，就徇私枉法，树立朋党。
陛下您虽然任命他为吏部尚书，但是他仍然不知满足，认为自己应该得到太尉一职，而耻于在长孙仆射，房中书之下。
像这种贪得无厌，不知感恩之徒，臣等认为，绝不可轻言特赦，以便警醒其他功勋贵戚，安分守己，低调做人。”
看到满朝文武都坚决反对特赦侯君集，李世民也不能一意孤行，他只好派人给侯君集送去一壶酒，让他自行了断。
侯君集跪在地上痛哭不止，临死前向皇帝求情说：“自从陛下起兵以来，臣就鞍前马后侍奉左右，现在犯罪受罚，死而无怨，只求陛下能给臣李泰下一个儿子，不知足让侯氏绝祀。”
按说侯君集是应该被满门抄斩的，不过李世民也不是铁石心肠。
主犯严惩，协从不问，这样也就行了。于是便宽恕了侯君集的老婆孩子，把他们流放到岭南，给他们一次从新开始的机会。