多秀家听了也觉得与其毫无应对，倒真不如试一试效果，也就表示了同意。
于是到了第五日，日军开始于城东筑高垒，准备乘高跃入城中，朝鲜军民果然也争锋相对，自己同样筑垒不说，还不断以火炮轰击日军垒顶。
日军火绳枪列阵野战虽然占优，但在这种时候硬拼射程却不如朝鲜军手里的火炮，挨了几顿乱轰之后承受不住了，最后只得放弃。
到了第六日，晋州城内箭、石都即将耗尽，金千隘、崔庆会、高从厚、李宗仁、黄进等人引领军民持续与日军撕杀，两军激战直至次日天明。
第七日，加藤清正下令所部日军将十辆新造好的龟甲车投入战斗，这龟甲车其实是受朝鲜龟甲船启发而造，加藤清正在攻城冲车上加盖数层厚板，整体强度坚固耐用，构造也算精巧，打磨更是精细，可档落石弓弩能用于冲击城门、城墙，日军也能借此助力登城，只是这东西太大了，行动起来笨拙缓慢。
崔庆会见此龟甲车虽然巨大，但却全为木质建造，二话不说便下令向龟甲车浇灌火油，然后射出火箭引燃，很快的时间之内便焚毁数辆。
加藤清正大吃一惊，急令将全部龟甲车撤回，然后乖乖模仿起中国历代攻城车的做法，在龟甲车外包上牛皮以防火烧，同时再次加紧赶造，运至各队。
于是又到了第八天，日军再度投入数十辆覆盖了厚厚牛皮的龟甲车，大批日军在其后，从各面再次发动攻城。朝鲜将领忠清道兵使黄进遭日军铁炮射中阵亡，伊达政宗率部登城。
这伊达部初来朝鲜，正想展示武勇，果然悍勇异常，几次登上城楼。伊达政宗本人盔甲鲜亮，与身边亲兵一起斩首众多，顿时成为朝鲜军的集火目标，日军为免伊达政宗有失，赶紧纷纷上前掩护其撤退。
金千隘闻黄进阵亡，便强迫晋州府使徐礼元督阵，徐礼元登城后，一见日军弹丸密集四射，顿时吓得魂不附体，狼狈逃窜下城，然后不知所踪。
忠清道副将张润气得大骂，主动上前接替督阵，可惜两个时辰后战死于城楼。而此时日军已有数支又登上晋州城，李宗仁、崔庆会再度号召百姓于城楼反击。好在此时天降大雨，朝鲜弓弩及日本火绳枪双双受潮，只能暂时罢兵。
战局至此看似再次陷入僵持，但其实晋州城墙在龟甲车两日来不断冲击之下，部分墙体已开始松动，再经过大雨冲刷，几处墙体已有崩塌之势。
第九日天一亮日军便再度攻城，加藤军首先攻破晋州一角，加藤部下武士及伊达政宗率先从此缺口突入城中，大队日军蜂拥入城，晋州军民被迫转入巷战，迎来的自然是无尽屠杀。
金千隘携子金象乾和崔庆会、高从厚等人退至石楼，眼见大势已去，金千隘慷慨道：“能与诸位在此合力一战，保卫家国，此生无憾！然事已至此，恐再无回天之力，此处便是我辈葬身之地了。”
高从厚深觉悲愤，感慨言道：“我自感无能，深恨未能亲自斩下小早川隆景首级告慰父兄在天之灵。父兄之言言犹在耳，我高氏一门绝无贪生怕死之辈，好在苦战至今斩倭寇无数，想来也无愧列祖列宗，更未给义军丢脸。即便今日再无回天之力，我等身躯也绝不能落在倭寇手中，受死后羞辱！”
崔庆会亦感慨万千，道：“诸位忠心豪情令我感佩，如倡义使所言，此次得以一同并肩作战，虽死无憾。今日虽逢绝境，亦有与诸位义结金兰之愿！今日得以同死，来世再结伴杀敌报国！不知诸位意下如何？”
众人皆深受感动，想一饮诀别酒，却不料侍者却早已逃遁。眼见日军已追至楼下，崔庆会引领众人朝北跪拜，临死前结为兄弟，齐跳南江殉国。
金海府使李宗仁勇力超群，率部转战四门，渐遭围攻被逼至南江。李宗仁见死不可免，便突然袭击，将两名日兵夹在肋下，大喊道：“金海府使李宗仁死于此！”然后携裹日兵转身跳入南江。
另一将领金俊民纵马巷战，往来冲杀，终因寡不敌众被火绳枪射落马下，遭乱刀砍死。城墙已破，晋州军民难敌日军进攻，死于铁炮和刀下者不计其数，其余百姓为避屠刀，也只能选择葬身南江。
日军屠城半日，焚烧民宅，推平城墙，掩井伐木，晋州成一片废墟。而后日军当夜彻夜狂欢，再作休整后便分批开进全罗道各处，朝鲜各军没了晋州坚城，自然难以阻挡。
晋州沦陷后，宋应昌下令戚金急进兵陕川、吴惟忠进兵草溪布防。而日军军师黑田官兵卫也于釜山收到了来自丰臣秀吉的命令，调其回国问罪。
黑田官兵卫返回日本后连番请罪，并于七月剃发出家，号如水圆清，此是后话，暂且不提。
作为曾经获得大捷的坚城，晋州失陷的消息震动朝鲜，更多人意识到在没有明军直接参战的情况下，仅凭朝鲜军和义军等对抗日军着实千难万难。
况且，由于明军不再接济朝鲜，朝鲜军的物资情况也越发困窘，且不说火器补充，便只是断了朝鲜军的火药补充，朝鲜军的战斗力就要大幅降低。而更根本、更重要的则是军粮方面开始出现短缺。
考虑到朝鲜农业生产主要依赖汉江平原，而汉江平原目前要么处于日军掌控之下，要么虽然已经