当上主降生世间施行救赎大工时，撒旦也是不甘心的。先是用各种方法想除灭在肉身的耶稣：借希律的手杀死孩童、趁耶稣睡着时兴起风浪、利用犹太人杀死耶稣……；再是用各种方法让耶稣从十架上下来。
当耶稣复活升天后，教会兴起，异端也随之兴起来。最早是割礼派也叫伊便尼派。伊便尼在希伯来文中意为“穷苦人”，故又译“穷人派”，这一派又叫犹化派。一到四世纪活跃于巴勒斯坦，倾向犹太教的基督教派。
他们恪守摩西律法和礼仪，不放弃一神的立场，在对待基督的问题上，承认耶稣是弥赛亚，他们反对耶稣是由童贞女玛利亚所生，并且否定耶稣是圣灵感孕，是先在的上帝之子。他们认为基督耶稣一开始并非是神子，只是由于他在遵守律法中表现出的美德而被上帝接纳为嗣子，后来被接到荣耀里。对基督的看法接近嗣子论；这一派是穷人，所以他们采用低的基督论。他们坚决不能容忍幻影派把耶稣当作上帝在尘世的幻影。因为犹太教思想中并没有上帝变体的说法。对于他们来说，耶稣仍然是上帝的创造之物，是一个具体的人。因为他们无法从存在的同一性上去理解耶稣和上帝的关系，而只能从一种限定的关系当中去理解。总而言之耶稣不是神。后来的伊教也深受其影响。
开始他们到处宣扬基督徒必须受割礼，不受割礼不得救。为此保罗赶回耶路撒冷，教会召开了第一次会议，并让保罗带着信传达给众教会。保罗在罗马书中说：倘若亚伯拉罕是因行为称义，就有可夸的；只是在上主面前并无可夸。经上说什么呢？说：“亚伯拉罕信上主，这就算为他的义。”做工的得工价，不算恩典，乃是该得的；惟有不做工的，只信称罪人为义的上主，他的信就算为义。正如大卫称那在行为以外蒙上主算为义的人是有福的。他说：“得赦免其过、遮盖其罪的，这人是有福的！主不算为有罪的，这人是有福的！”如此看来，这福是单加给那受割礼的人吗？不也是加给那未受割礼的人吗？因我们所说，亚伯拉罕的信，就算为他的义。算为他义”的这句话，不是单为他写的，也是为我们将来得算为义之人写的，就是我们这信神使我们的主耶稣从死里复活的人。稣被交给人，是为我们的过犯；复活，是为叫我们称义。
还有就是深受诺斯替教影响的派别，又称灵智派。起源于一世纪。二三世纪盛行于地中海东部沿海地区，五世纪衰落。关于诺斯替教的渊源、特点和主要教义，现代学者并无一致见解。一般认为它是一种哲学与宗教的混合体系，流派混杂。它主张本体上的二元论，强调得救的条件在于获得“诺斯”(意为真知)；物质世界并非至高上主所创，而是一位典米尔（意为巨匠造物主）所造。并有一套复杂离奇的宇宙生成论（流溢说）学说。基督教产生后，该教一些派别吸收了基督教某些观念，形成基督教诺斯替派。诺斯替派认为救世主基督从上主流出，为的是到世上来拯救从上面坠落的属灵的人──从上主坠落的，必须由上主来恢复他们的本来面目；耶稣的使命是要把人类从物质和感性世界中拯救出来，他自身不带有肉身的弱点或污浊。该派还主张善恶二元论，认为善与恶为互相对立的两个根本原则，精神属于善因，肉体属于恶因；人类因有肉体，不能与上主直接交往，必须依靠中介。基督救人，在于赐人智慧，使人知道如何从肉体桎梏下解放出来。人类应当与上主合作，刻苦禁欲。为此规定某些食物不可触摸尝食，并禁止婚娶。受此影响的一些派别（如伊便尼派、马西昂派等）因之被称为禁戒派。早期教父著作多加以驳斥。
诺斯替派的名字，在希腊文当中的意思为'知识'，因此有时也被称为‘灵识派’。在西元一世纪到二世纪之间盛行于地中海岸，故被早期基督宗教视为最有威胁性的异端之一。诺斯替派曾在叙利亚和亚历山大港建立起自己的崇拜组织，但在西元三世纪之后由于被基督宗教打压而消失，之后仍然能在犹太教，基督宗教及伊教的某些派别中看到诺斯替派的影响。他们宣扬圣洁的神是不可能有污浊的属物质的身体的。耶稣的一生是神在地上的幻影。所以这一派也叫幻影学说。
当时使徒大多已经为主殉道，聂兴源来到使徒约翰面前，向约翰讲述了上主创造宇宙万物直到耶稣降世，并告诉约翰耶稣实是上主大道成为人的样式。既是实实在在的上主，又是实实在在的的人。否定耶稣是上主和否定耶稣是人都是错谬的。使徒老约翰为此写了约翰福音和约翰一、二、三书。申明耶稣是道成肉身的：太初有道，道与上主同在，道就是上主。这道太初与上主同在。万物是藉着他造的；凡被造的，没有一样不是藉着他造的。生命在他里头，这生命就是人的光。光照在黑暗里，黑暗却不接受光。有一个人，是从神那里差来的，名叫约翰。这人来，为要作见证，就是为光作见证，叫众人因他可以信。他不是那光，乃是要为光作见证。
那光是真光，照亮一切生在世上的人。他在世界，世界也是藉着他造的，世界却不认识他。他到自己的地方来，自己的人倒不接待他。凡接待他的，就是信他名的人，他就赐他们权柄