司马懿戎马生涯，特别是后半生，几乎都在行军打仗。
和诸葛亮不知道交手了多少次。
是三国之中，是唯一一个让诸葛亮感觉相当棘手的人物。
几次出手，互有胜败。
除军事方面外，司马懿在魏明帝大修宫室之际他也加以劝谏，魏明帝驾崩后他奏请罢修宫室，雕玩物之人力，节用务农，使天下欣赖。
识拔人才上，司马懿从寒门中提拔了邓艾、王基、州泰等人才，如虞预所说，经略之才可谓远矣。
经济上，司马懿在上邽兴屯田，京兆、天水、安南兴冶铁，穿成国渠，筑临晋坡使雍凉足足食，并有余力供给关中不足。后来又大兴屯田于淮北，穿广槽渠，这些作为不但厚植了国力，也为日后西晋统一九州奠定基础。
司马懿在推广屯田，特别是军屯事业上有很大的建树。约在建安二十三、四年，司马懿由转为丞相军司马后，向曹操建议：“昔箕子陈谋，以食为首。今天下不耕者盖二十余万，非经国远筹也。虽戎甲未卷，自宜且耕且守。”
曹操行之。魏国一时“务农积谷，国用丰赡。”
《晋书·宣帝纪》曹魏和吴、蜀对立地带的两大军屯基地的开创，都和司马懿有关。
曹魏和蜀汉的邻近地区，如长安、槐里、陈仓、上邽等地，都设置有民屯和军屯组织。
其中，上邦的军屯最著名。这个军屯基地是在太和四年由司马懿上表倡议建立的，《晋书·食货志》称：“宣帝表徙冀州农夫五千人佃上邽，兴京兆、天水、南安盐池，以益军实。”
主持具体事宜的是那时的度支尚书、司马懿的三弟司马孚。
《晋书·安平献王孚传》：“关中连遭贼寇，谷帛不足，遣冀州农丁五千屯于上邽，秋冬习战阵，春夏修田桑。由是关中军国有余，待贼有备矣。”
上邦军屯是在司马懿、司马孚兄弟的共同筹划下开创的。
太和五年，诸葛亮进攻天水。
这时上邽军屯上的小麦已经生长出来，有人主张“自芟上邽生麦以夺贼食”，魏明帝不从，“前后遣兵增宣王军，又敕使护麦”。
司马懿与诸葛亮相持，多亏以上邽军屯的小麦作军粮，才取得胜利。
直至正元二年，安西将军邓艾又在上邽“为区种之法，手执耒耜，率先将士”，进行屯垦，都说明上邽军屯的重要。司马懿在太和五年屯长安，都督雍、凉二州诸军事，开始主持对蜀的战争。为了增强实力，很重视对关中屯田基地的建设。
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司马懿在世的时候，在魏国威望是相当之高的，即使毌丘俭、文钦在其死后讨伐司马师，檄文中依然对司马懿有“故相国懿，匡辅魏室，历事忠贞”等赞誉。
史书上称其使“天下欣赖”“天下大悦”。
到晋朝初年，司马炎在太康年间做到了“天下无穷人”的太康之治，人们对推动三国统一的司马懿还是相当推崇。乃至司马遹被传像司马懿，而能在当时“誉流于天下”。
司马懿的名声毁败，是从永嘉之祸以后开始。
其不肖子孙自相残杀带来诸多浩劫，南方的东晋，又长期被世家大族把持，司马懿在人心中的地位也逐渐下降。
晋室南渡，情况与当年蜀汉类似，以蜀汉为正统的呼声日高；东晋灭亡后，情况更加明显，到隋唐时代，民间说书戏曲日盛；而唐代官修的《晋书》，以帝王的立场更不鼓励效法。
到明代《三国演义》之后，“空城计、火熄上方谷、见木雕魏都督丧胆”等不实的司马懿形象就被演义广传于民间了。
李世民为《晋书·宣帝纪》作史论：“宣皇以天挺之姿，应期佐命，文以缵治，武以棱威。用人如在己，求贤若不及；情深阻而莫测，性宽绰而能容，和光同尘，与时舒卷，戢鳞潜翼，思属风云······文帝之世，辅翼权重，许昌同萧何之委，崇华甚霍光之寄。当谓竭诚尽节，伊傅可齐。及魏明帝将终，栋梁是属，受遗二主，佐命三朝，既承忍死之托，曾无殉生之报。
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顺理而举易为力，背时而动难为功。况以未成之晋基，逼有余之魏祚？虽复道格区宇，德被苍生，而天未启时，宝位犹阻，非可以智竞，不可以力争，虽则庆流后昆，而身终于北面矣。”
李世民对司马懿的评价十分高。
扶苏对司马懿的评价也十分高，但是因为《三国演义》的影响，扶苏还是觉得，诸葛亮比较好。