始皇帝在会稽郡住了很长一段时间。在此期间，他又南下，经过吴程、余杭、钱塘、山阴，登上了会稽山观光。始皇帝此次出巡，他的身体已经出现了不适的症状，健康状况极为不佳，一路上只有在接见大臣时，他是坐着的，其余的时间都是躺在车上。他在会稽山的禹王庙里祭拜完大禹王后，就对百官道：“禹王胸怀天下，为治水患积劳成疾，因此老百姓都很敬仰他。他在这里还会计核算过国家的税收，评定过诸侯的政绩，从此人们就将此山称为会稽山，会稽嘛就是会计的意思。朕也有统一天下的功劳，千秋万代之后，不知人们对朕是如何评价的？”李斯诚惶诚恐道：“陛下灭六国，废封建，创郡县，这是影响后世的伟大创举，千秋万代之后，您的美名必将超过大禹王啊！”始皇帝听了李斯的话，顿时感到十分欣慰。
始皇帝又想起了清夫人，就对李斯道：“爱卿，你应该再撰写一方碑文，向天下之人提倡清夫人的贞洁品德，一定要端正人们的操守啊。”李斯就撰写了一篇碑文，再让石匠刻在石碑上，这就是《会稽刻石》。文字中除了歌功颂德以外，还有劝人为善，端正品行，提高自身修养的教化功能，现将部分译文补录于下：
矫正人民的过错，宣扬大义，凡是丈夫死了有孩子相伴，却抛弃孩子改嫁他人，就要判重罪惩罚她的不贞洁。还要用礼仪隔绝内外，严加防范，禁止男女通奸犯淫，男女必须洁身自好讲诚信。若是有妇之夫(jian)淫了别人的妻子，那么杀死这个奸夫不算有罪。若是男子行为端正，而妻子跟别的男人跑掉，子女可以不认她这个母亲。社会如此一来，老百姓都蒙受了教化，也会变得廉正清明。治理社会还要改变一些鄙陋的恶俗，使全民承受一定的教化，这样善经美典才能改变每一个人。若是人人都知道遵守法度，邻里才能和睦友好相处，天下之人也能听从王令。若是国民都修到内心纯洁美好，那么人们才能自愿地遵守法度，吉庆欢乐还可以确保天下的太平。后世的人们都如果奉公守法，国家就一定能长治久安，这就好像是车船永远不会倾覆是同一个道理。
这些文字中流露出来的教化思想，在今天看来还是很有现实意义。始皇帝随后又回到了吴县，然后落实博士们的政绩。数日后，就起驾北上，来到江乘，改乘轮船，顺着长江出海，一直来到了琅邪台。始皇帝便再次登台观望，他回想九年前徐福出海的事情，一切历历在目，便仰天长叹道：“人生如白驹过隙，纵然一世，也只是转瞬而已。想起从前，多少人都想要朕的命，他们或用剑刺、或用筑掷、或用锥击、或用刀砍，杀朕不下五次之多，但朕今日依然健在！而他们呢？就象大海中的沙粒，早被无情的海水吞没了。但天命在我，人何以堪？但让朕担忧的是荆楚一带流传着这样一句话：‘楚虽三户，亡秦必楚’。他们对朕为何如此仇视啊？”李斯道：“虽然老百姓在短时间内不能理解陛下的治国方略，可是在千秋万代之后，您的伟大事功必将为后世的人们所瞩目啊！”始皇帝道：“朕已五旬，壮年将尽，只恨天数有限，人寿有期，实在是没法改变生老病死的规律啊！朕曾让徐福寻求长生之术，可他一去不回；茅盈求仙也是骗术；卢生炼丹亦是谎话，更可恨的是他们耗去了大量的钱财，结果使朕求仙未果，反而获罪于天下，这都是他们的过错啊！”群臣见皇帝自叹自责，就一齐高呼：“陛下珍重啊！”
始皇帝是个很自信的人，他总认为他就像太阳一样永远光照大地，永远不会陨落。可是太阳也有早晨，中午和黄昏之分，他更不知道自己已经是黄昏的
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太阳了。就在出巡的路上，他的体力一天不如一天，此时他也已经预感到死亡的威胁在逐渐逼近，因而他时常感到孤独寂寞，尤其是对死亡感到前所未有的恐惧，所以他不让人们提到‘死’这个字。这几天来，他始终是精神不振，饭吃不下，觉睡不着，也不许别人打扰，他就这样一个人静静地躺在翠华帐中，回想起从前发生过的一些事事非非……
突然一声巨响，始皇帝看到海面上竟然跳出了一位金甲天神来，他手中握着长剑，一耸身就跳上了云头，站在空中大笑，样子相当的可怕。始皇帝问：“嗨！你是何方神怪，在此兴风作浪？”金甲神道：“你这小邦之君，怎么不认识我？真是孤陋寡闻啊！哈哈，你有何本领，也敢到此来抖威风？”始皇帝听他出言不逊，大怒道：“哪来的妖怪，竟敢藐视朕？朕是大秦国始皇帝，你竟敢说朕是小邦之君？”金甲神道：“我掌管茫茫水域，境内有八方海岛，岛外有水，水外有岛，尚且不敢尊大。你反倒把自己管理瓦片大小的地方也妄称是大秦国？还敢自称为始皇帝？真是愚昧无知，不自量力！”始皇帝申辩道：“你说我的国家只有瓦片大小，有何凭证？”海神道：“你随我来，让你看个明白。”
始皇帝就纵身一跃，也跳在半空里，便踏住云头，忽听耳边呼呼生风，一会儿就飞到了九霄云外。海神大叫：“停！”始皇帝就睁眼俯瞰，便大吃一惊。只见蓝色的大海确实是无边无际，水面上只是露出了几块不大的岛屿。再仔细看秦国，北方修建的长城历历在目，只是大秦国真