二条城流血事件次日，京都附近几个藩的援军陆续赶来，让幕府总算有了可供调遣的人马，德川家纲便下令京都地区进入戒严状态，同时对近期制造事端，传播流言的流浪武士进行搜捕。
这无疑进一步加剧了京都的紧张局势，为免受到波及，难民中的一部分人开始逃离京都，另一部分人则是选择了前往本地的各处庇护所，希望能够避开这一轮大乱。
而京都本地民众的生活也受到了极大的影响，绝大部分的商铺作坊都选择了关门歇业，街上行人也变得稀少，城区到处是一片萧条景象。
前往难民营执行搜捕任务的是德川家纲的近卫军，堪称是幕府军中的精锐，虽然人数不多，但装备十分精良，且都是幕府武士出身，战斗力和忠诚度都毋庸置疑。
只是这支精锐到了京都南部的难民营却扑了个空，原本收容了数万难民的营区，如今却只有百十来号人了。
这里仅剩下一些行动困难的伤病号，但凡身体健全能够走动的人，都已经听到了幕府要抓捕难民的风声，主动提前离开了难民营。
原本预计至少要两三天才能完成的任务，这下直接就宣告结束了。而且这里的情况还没法随便抓几个人回去交差，就算傻子也不会信搅乱京都的竟会是这么一帮老弱病残。
要知道难民们的去向，当然也不是什么难事。只是要去这些特殊地点搜捕目标，肯定会遇上一些阻力，只能先汇报情况，请示下一步的行动。
德川家纲听闻难民最新的聚集地多是寺庙、禅社这类地方，不免也有些头疼，更何况其中还有御苑和海汉商栈这类不便动手的地方。
但如今架势都已经做出来了，总不能高高举起轻轻放下，也还是只能硬着头皮，让麾下部队继续执行搜捕任务。不过需要暂时先避开御苑和东海行这两个敏感地点，以免招惹不必要的麻烦。
德川家纲坐在二条城里下命令容易，但那些寺庙、禅社又岂是好处理的对象。
这些宗教机构为了维持悲天悯人的形象，必须得给予难民庇护，更何况昨天才发生了严重流血事件，哪怕只是装模作样，也得出面阻拦上门执行搜捕任务的幕府军。
而幕府军得到的指令，并没有允许他们大开杀戒，反倒是要求他们尽可能控制住事态，避免激化出新的冲突，尽量减少任务过程中的死伤。
所以搜捕行动很快就变成了幕府军与僧人和神官的对峙，要动用武力降服这些手无寸铁的人当然不难，但这势必又将造成更严重的矛盾，毕竟这些宗教机构在民间的号召力，可能要比幕府还大得多。
当然如果仅仅只是对峙的程度，还远不足以让策动此事的那些人感到满意。要想让事态继续发展，那就必须得让冲突持续发生。
在难民聚集的东福寺、八坂神社等地，很快就发生了新一轮的流血冲突。
由于场面混乱，冲突的起因已无法查证，但事后在民间流传的说法非常一致，均称是幕府军率先开枪，射杀了阻挡他们进入难民聚集区的神职人员，随即遭到了部分愤怒民众的反击。
开火的究竟是幕府军，还是躲藏在暗处的浪人武士，那已经不再是事情的重点。
前往东福寺的幕府军冲破僧侣阻拦后，混乱局面却在持续扩大，慌不择路的难民发生了踩踏，有数以百计的人倒地不起。
八坂神社的情况也与之类似，由混乱造成的踩踏事件带走了至少上百条人命。
执行搜捕任务的幕府军也不是全无伤亡，在东山慈照寺的搜捕中，他们还真撞见了躲藏在这里的一群浪人武士，双方拼杀中至少有二十余名幕府军被杀伤，而浪人武士在被包围之后，也全部力战而亡，竟无一人被活捉。
这下跟浪人武士一同待在东山慈照寺的几千难民，都被迫背上了叛党嫌疑，一个都不能放走了。
人虽然是走不了，但消息却封锁不住。所有发生了流血冲突的地点，很快都有相关的消息传播出来。
而幕府此时还在忙于善后，根本来不及公布行动结果，这也就再次给各种经过添油加醋的流言留出了巨大的空间。
于是新的传闻也越来越变本加厉，甚至到了耸人听闻的程度，称幕府军在多处难民聚集地实施了屠杀，就连僧侣和神官也没放过。
还有人称东山慈照寺里里外外几千人被杀了个精光，一个活人都没留，说得有鼻子有眼，并且以当地被幕府军完全封锁为证——如果不是把人杀完了，为什么要把那地方全封住不许进出？
这些传言真假难辨，且幕府也难以自证清白，要说冲突中没死人那肯定没人信，毕竟也不可能百分百地封锁住消息。但要自辩说其实死的没有传闻中那么多，那这澄清的效果恐怕还不如装死不作回应。
这无疑将幕府置于了一个极为不利的处境中，一方面此时讨伐九州的战事正在吃紧，另一方面幕府却对因此背井离乡逃到京都的难民实施了屠杀，那么幕府与所谓的九州叛军，到底谁才是正义的一方，恐怕就不再是幕府单方面说了算了。
就在这个节骨眼上，九州前线的战报终于是传到了京都。
尽管详细的交战过程仍是只有幕府高层才能看到的军