现在的故事聚焦于夜袭队中，准确的说是夜袭队a、b、c、d四组之一的a对之中。
这个由队长和仓英辅，副队长西条凪，以及三位队员石堀光彦，平木诗织还有孤门一辉这三人组成的五人小组之中。
往往邪恶总是会隐藏于让人意想不到的地方……
而《奈克瑟斯》奥特曼剧本修改后，里面最大的邪恶，宇宙最凶恶的破坏神黑暗扎基, 便隐藏于夜袭队里面石崛光彦队员的身体上面！
石崛光彦，不，准确的说是山冈一，其人是十八年前时被来到地球的黑暗扎基使用凭依能力强行附身并抹除意识的人类科学家，这些年里面他都是披着人类的马甲，实则是以黑暗扎基的意识在行动着！
黑暗扎基没有完全复活, 作为人类行动的这些年里面, 他一直跟随着蓝星对付异生兽的终极战队夜袭队, 黑暗扎基的人类体作为夜袭队的一员，他与那些队员们一起，经历过千辛万苦击败了无数被他强化过为人类带来痛苦与绝望的异生兽！
同时黑暗扎基也见证了那拥有着他的宿敌诺亚奥特曼一般光之能量的光之巨人奈克瑟斯奥特曼，一次又一次拼死一般的英勇战斗！
对此黑暗扎基的内心充满了戏谑与不屑，那是站在暗处，便可以掌控全局，把一切生物耍的团团转，对自己实力上的绝对自负！
他要让所有人因为他的存在而绝望痛苦！而且他有信心做到这些，至于奈克瑟斯，黑暗扎基笑看着这位强大无比的光，把自己的适合者折磨的不成人样的样子，这对于他来说是每天的保留节目，他对看着人类因为过大的光受到伤害，明明就是凡人，却逞能打扮成英雄的样子，而感到好笑！
对于贩卖绝望与痛苦, 以黑暗能量为食物的黑暗扎基来说，他永远无法理解人类传递光芒的行为, 他永远听不懂, 光是羁绊的力量，人类与奥特战士之间的羁绊究竟是什么……
而巧合的是，在这小小的基地内，还有一个人不屑于这个脆弱的羁绊！
在黑暗扎基凝视黑暗，于黑暗之中找快乐的时刻，黑暗也在凝视黑暗扎基！
作为黑暗宇宙大皇帝的朱庇特，一直潜伏起来，默默地注视着黑暗扎基，在黑暗扎基嘲笑奈克瑟斯的时刻，朱庇特正在嘲笑黑暗扎基。
扎基的保留节目是笑话奈克瑟斯，并思考下一次用什么样子的手段狂虐奈克瑟斯，而朱庇特没一天的保留节目是，看着黑暗扎基布置场景挑选演员，然后被打算陪着他玩玩的诺亚小号奈克瑟斯狂扁。
这就是朱庇特的快乐……
如果扎基知道在他嘲笑光明的时刻，更深的黑暗正在嘲笑他，他一定会怒骂：“我真是服了昏君这个老六了……”
而以诺亚的视角则是，区区一方破碎的小世界, 真是何德何能可以同时聚集，卧龙凤雏两位贤才？！本是凑够一个，便可以拍摄一部电视剧了，现在二人齐聚，真是太过难得！
“哈哈哈哈，愚蠢的人类！”
黑暗扎基冷笑着。
“哈哈哈，愚蠢的黑暗扎基！”
朱庇特嘲笑着黑暗扎基。
“……”
诺亚自我封号中。
就在三人互相隐瞒着身份，在这小小的星球上玩着过家家的时刻……
黑暗扎基动了！
“是时候了！不怪我布局这么些时间，那个女人终于拥有了变成奈克瑟斯的资格，而奈克瑟斯的力量也足以让我复活了！”
“哈哈哈哈……”
“这个星球我已经完全呆腻味了，是时候让着一切毁灭了。”
黑暗扎基疯狂大笑着，他的神色之中，充满了对自身所在星球的不屑，一场大戏在他的布局下，搭建好了舞台，这是一场震惊这个世界的最终幕！
“那个傻子终于准备动手了！”
“就让你这个傻子稍微瞧瞧，什么叫做黑暗……”
朱庇特身穿白色的大衣，冷冷一笑，他做好了在关键时刻插手的准备。
当一切主要目标齐聚终极舞台！
黑暗扎基当着夜袭队副队长西条凪的面，说出了十八年前的真相，以及西条凪父母真实的死因之后！
西条凪彻底癫狂了！
“你这个混蛋！”
西条凪愤怒地拔出了信赖进化者，她的浑身上下散发着漆黑的负面情绪。
“不要！西条凪，千万不要变身！”
先知似乎已经预见过了眼前的一幕，他瞧着愤怒的西条凪，净空地瞪大了双眼，似乎在的眼里，当西条凪因为愤怒失控而变身之后，将会有很大的危机降临一般……
“啊！！！”
虽然说西条凪已经得到了先知的警告，但是她依然手握信赖进化者，在黑暗与绝望之中，完成了变身。
“轰！”
恐怖的黑色闪电充满了眼下的空间，一位散发着漆黑气场的奥特战士，瞬间出现在了众人眼前！
“去死吧！”