值得庆幸的是，匠作畠山家的本据七尾城是一座难攻不落的城池，而且城内的守军也在顽强抗击加贺一向一揆众，这就使得畠山骏河守等人无法在短时间内攻落七尾城。由于畠山骏河守等人并没有任何水军众的支持，故而无法对能登岛进行攻击，越后上杉家也因此能通过海路将军粮源源不断的送入七尾城中。
缺少水军支持以及没有大型攻城器械的畠山骏河守等人只能望城兴叹，并且逐步占据先前匠作畠山家家臣们放弃的城池兵砦，打算以此来对七尾城进行长期的围困。在此期间，畠山骏河守等人接连夺取了多茂城、荒山城、青谷城、金丸城、馆城、福次城、小丸山城等众多位于鹿岛郡、羽咋郡的城池兵砦。
不仅如此，畠山骏河守还打算切断能登与越中方面的联系，迫使固守在七尾城内的匠作畠山军出城来与自己进行决战。
八条景定为了达到出其不意、攻其不备的目的，他直到行军至守山城与柿崎景家等越中诸将合流之后才开始对外宣布出阵能登救援匠作畠山家的消息。
而此时的畠山骏河守等人仍然在围困七尾城，在突然接到了越后上杉军出阵的消息后，完全出乎于他们的意料之外。
畠山骏河守等人自从举兵攻入能登开始就完全没有想过作为匠作畠山家盟友的越后上杉家会出兵救援，因为他们认为越后上杉家会先协助小笠原长时、村上义清等信浓诸将恢复旧领，故而对此完全没有任何的防备。
畠山骏河守等人在胜山城紧急召开军议后认为只有在邻近越中边境的荒山城和福水馆两地增派兵力布防，同时加紧对七尾城的攻击，必须要在越后上杉军进入能登之前将七尾城攻落，如此一来越后上杉军就只能撤兵返回了。
而畠山骏河守此刻也想不出更好的应对之策，也就只能派遣畠山九郎和畠山胜禅寺各率军一千余进驻福水馆和荒山城两地进行布防，以此来阻遏上杉军不断西进的势头。为了增加己方的胜算，畠山骏河守还致信加贺一向一揆众，希望他们能够继续增派大量兵力进入能登协助自己。
杉浦玄任、超胜寺实显、光德寺乘贤、下间寿法等加贺一向一揆首领们在接到畠山骏河守的书信之后也深知越后上杉家介入能登之后的后果是什么，当即派遣下间赖秀、下间赖盛等人率三万余加贺门徒众进入能登，并且致信越中一向一揆众的瑞泉寺证心、胜兴寺显荣等人，要求他们立即召集门徒众出兵北上攻打北射水郡，打算以此来牵制即将进入能登的越后上杉军。
加贺一向一揆众为何会如此卖力的支援畠山骏河守等人，还是因为前任匠作畠山家家督畠山义总联合神保长职、朝仓孝景攻打加贺协助小一揆一方。尽管最终的结果是大一揆一方获胜，并且于津幡一带击退了越中、能登等他国势力的侵攻，但是小一揆一方的首领若松本泉寺等不少残余还是分别逃到了越前和能登两国之中，得到了朝仓家和匠作畠山家的庇护。
眼下正值匠作畠山家内讧之际，加贺一向一揆众怎么能放弃这个绝佳的报仇机会呢？一旦他们助畠山骏河守夺取了能登四郡，那么之前约定好的羽咋郡一郡之地就归佛国管辖了，之后剩余的三郡之地还能正大光明的进行布教，何乐而不为呢？
在进入九月后，秋雨更是连绵不绝，畠山骏河守一方的营地越来越潮湿泥泞。畠山骏河守见麾下将士多有伤病，七尾城又一时难以攻克，便开始考虑退回加贺重整旗鼓之事。
但是在军议上，能登一向一揆众出身的吉田浦左卫门、小森大右卫门、伊势八郎右卫门等人却坚决不同意退兵，他们深知若是加贺一向一揆众的大军撤回了加贺，那么孤立无援的能登一向一揆众就必然会被匠作畠山家集中兵力迅速攻灭而身首异处，便向畠山骏河守谏言道：“邻近诸国，窥此举一岁矣。今义续已困，奈何舍之去！”
畠山骏河守在沉思片刻之后，亦认为眼下还不可仓促退兵返回加贺，于是便与诸将再次商议破敌之策。
然而，就在畠山骏河守还在召开军议的同时，担任上杉军先阵的内山满久率控鹤军下辖的五百名骑马武士在福水馆城外点燃周边的民居村落。
固守在福水馆的畠山九郎与前来支援的下间赖盛在商议过后决定趁着上杉军眼下来援的军势寡少，一举将这一部上杉军歼灭，以此来震慑越后上杉家，使其不敢继续支援匠作畠山家。
随即，畠山九郎就与下间赖盛率一万一千余军势从福水馆倾巢而出，内山满久见状当即率五百名骑马武士全部后撤，将一向一揆众全部吸引至清水原。
畠山九郎和下间赖盛仍然穷追不舍，一路尾随上杉军至清水原。但是他们此刻却并没有料到为何自己所率的以步卒、门徒众组成的一万一千余军势能追上全部以骑马武士组成的上杉军先阵。
就在这时，早就埋伏在三尾、见砂两地的上杉军趁机向散乱无序的一向一揆军发起突袭了，内山满久也率军返回突入一向一揆众阵中。畠山九郎和下间赖盛二人皆是惊惧不已，完全没有任何机会来收拢军势迎击正在三面袭来的大量上杉军。加上漫山遍野之上全是上杉军的竹雀纹旗，这就让一向一揆军认为上杉军还有大量军势埋伏在那里。