与毛钰升官一同传来的还有另外一个消息，那就是前辽东巡抚袁崇焕终于被处决。尽管毛文龙回到杭州后在毛钰的劝说下并没有发动任何力量对袁崇焕进行反击。
但是东虏十万大军南下的事实沉重打击了在东林党内部原本地位就不稳固的袁崇护那，他在辽东之所以那么蛮狠，全然不顾大局一样要拆散东江，一个重要的原因就是为了保住他来之不易的地位。与东虏议和也是一招险旗，结果东虏没有和袁崇焕想的那样暂时收敛而是长驱直入。
京城被围困，从山海关到保定、河间上千里的疆域内数十座城池被攻破，人口、财货损失惨重。这总要有人来背锅。而年轻气盛的皇帝认为他如此信任袁崇焕，结果在满朝大臣的弹章中袁崇焕简直就是十恶不赦，他赶到一种被辜负。他很想报下袁崇焕，结果其他的大臣不依不饶，就连东林党人都不愿意放过袁崇焕。
当然这中间还有毛文龙父子的原因。不是因为毛文龙有多么重要，而是毛钰先是在登州附近全歼了东虏水师。孙元化说是毛钰的功劳，宠真认为这是孙元化见毛文龙可能无法起复想让毛钰因此获得皇上的信任。接着浙江、福建巡抚的奏章到了，又是大胜，还是毛钰。当然也有人提到了毛文龙的家丁。崇祯也终于放弃了袁崇焕，因为毛钰的接连的胜利表明了毛文龙和他的东江是真正有实力的。
袁崇焕所提出的以辽人守辽土，以辽土养辽人，防守是正规的策略，攻战是变通的策略，和议是辅助策略的说法。其实包括皇帝和朝中文武是知道而且讨论过的并没有提出什么尖锐的而易见。但是袁崇焕的罪名却是余后东虏有密约。说袁崇焕有私心，毛钰决定一点不冤枉，单丝要说袁崇焕企图出卖大明利益甚至投靠东虏是站不住脚的。
尽管从努尔*哈赤开始时代开始建奴就像开了外挂一样风战必胜。但是在大明尤其是读书人眼里，建奴就是一化外蛮族顶多在辽东蹦跶。袁崇焕深得皇上其中，让他成蓟辽督师还兼管登莱和天津军务。这已经是除了内阁之外文臣的顶峰！他袁崇焕投靠一个完全看不到夺取政权可能的地方小实力图什么呢？
袁崇焕被处死的消息传到杭州毛家上下以及那些与毛家交好的家族都是欢欣鼓舞。毛钰却高兴不起来，原因无他，他知道自此不但东虏失去了一位劲敌，关宁军和辽西军阀也失去枷锁。再也没有人真正能够和袁崇焕一样用战绩和威望亚服那些将门世家。
毛钰来自后世自然受到各种资料的影响。在它看来正如金庸先生所说的那样"袁崇焕真像是一个古希腊的悲剧英雄，他有巨大的勇气，和敌人作战的勇气，道德上的勇气。他冲天的干劲，执拗的蛮劲，刚烈的狠劲，在当时猥琐萎靡的明末朝廷中，加倍的显得突出。"
很多后世人认为袁崇焕是我们中华民族的一个伟大英雄，我们岳飞、袁崇焕都是在中华民族历史上有褒有贬，经历坎坷，但是最终一条，人民的眼睛是雪亮的，历史是公正的。冒雨不知道怎么说服自己周围的人，反正他没有那么仇恨袁崇焕了。
袁崇焕的事迹、评论几百年来一直争论不休，正如孟森在《明本兵梁廷栋请斩袁崇焕原疏附跋》中提及，明末时期历史记载十分混乱，即使是与其耳目相关的人，其恩怨纠葛也尤其复杂。其中，主要争议的集中点是袁崇焕杀死毛文龙之过及是否背叛明朝政府等。
毛钰因为在京城有一些眼线，因而他也知道袁崇焕因为行事作风的问题，曾经让器重他的孙承宗大为震怒，擒杀毛文龙也是袁崇焕擅自主张。虽然没有成功但性质恶劣。与孙承宗不和的王在晋认为袁崇焕虽然死于国法，但是他的功劳不可淹没，但同时，他也认为袁崇焕的死是自取灭亡。而唐甄、谈迁等人则视之为明之良将。总之袁崇焕必定会成为历史上的争议人物，不过一切都会风吹雨打去。大明朝廷似乎并没有好的人选替代袁崇就匆忙处死袁崇焕，最高兴的自然还是东虏。
这件事情也让毛钰再次意识到历史的车轮滚滚向前，惯性很大，他这个小人物尽管在东南沿海搅动风云，但依旧没能改变袁崇焕这个关键人物的命运。
所以毛钰知道自己要抓紧时间布局了，要尽快掌控东江才有可能在将来局面出现大的变化的时候有力量来改变。
而在此前来杭州的毛承禄给毛钰带来了一些不好的消息，首先是朝廷没有确定陈继盛的东江领导地位。东江如今还是四分五裂的状态。虽然从原来的四协变成了两协，但因为当年毛文龙的蒲公英政策，大部将领其实是各自领兵驻守一地，加上东江得到朝廷的支援不足，所以在毛文龙离开之后向心力自然不足。
毛承禄当然希望毛钰支持他上位。尤其是毛钰如今在杭州的实力以及毛家在浙江一带的影响力如果毛文龙或者毛钰出面在朝廷上运作一番，再加上毛钰船队的支持是有很大可能的。
毛钰答应毛承禄可以动用自己的一些人脉，不过毛承禄在毛文龙辞官之前只是皮岛参将，说得不好听一点就是毛文龙的家丁头目，是专门负责毛文龙和其他将领以及家眷安全的，对于全局和战场统帅是欠缺的。
不过这时代的读书人就那么些还大部分是腐儒，辽东那么复杂的局