政府发给冬夏装，配备武器，每人每月发给米五斗、盐一斤；新附军士的装备，全部由政府供给，每人每月发给六斗米、一斤盐，并给其家庭发放四斗米、一斤盐。汉军军士服装的不足部分以及其他装备与开支，则由军户自理。
大体有这样几种办法：或是由军户直接将所需费用送到军中，称为封椿钱，也叫封装钱；或是由所在军队预以官钱，给戍军费，而以各奥鲁所征还官；或是先于奥鲁内收敛数足，解中书省纳讫，凭都、省咨文数目，于行省见在钱内支散军人用度；比较普遍的是，由各万户、千户派人到军士所在奥鲁，协同差来的千户、百户，向正、贴军户征取。
但是出征军人每年所需各项费用是相当大的。征戍远方，一兵岁费，不啻千缗、千缗，这相当于五十至百石米的价值。承担这样的开支，对许多军户来说是很困难的。由于军户负担过重，加之军官对士卒的剥削和压迫十分残酷，以至军户日蹙，军官日富。贫苦军户却仍被迫出军，久服劳苦，近者六七千里，远者万里之外，每遇收捕出征，万死一生。为此，不少正、贴军户常常不得不典卖土地，有的甚至沦为乞丐。
“右相，话是如此，但也要体谅小将的苦衷！”巴儿术皮笑肉不笑地道。
“此前每逢征战，还能有些赏赐和抢些财物。可平定了南朝之后，朝廷令各军镇抚一方，实行军屯，所属各军辛辛苦苦开垦荒地，刚将地养熟了，有了些收成。但是朝廷却又要增加赋税，将余粮尽数收走不说，却又在这春耕之时南调，田都没有人耕种，定是要减产的。却还要自备粮饷，衣装，制造武器，待秋后缴了税赋，剩余的恐怕都熬不过冬天去。小将手下还有数万张嘴等着吃饭，不早做些打算又如何应付！”
“本相自会向朝廷请免赋税，而你们只需打赢这一仗，江南如山的粮食，数不清的金银便都是囊中之物，还愁过了冬，吃不上饭！”伯颜听了只能画张饼先给他们，当下到处伸手要钱，朝廷都快揭不开锅了，拿什么补贴他们。但也知其所言不假，此战要是胜了一切都好说；可若是败了，虽然能少些吃饭的，但淮西和淮东这两边主要的税赋之地也颗粒无收的话，那么饥荒也就在眼前了。
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他深知当前的情况，在设有军屯的各卫军，士兵被分为正军和屯军两部分，分别编组和管理。土地主要是因战争破坏而荒废的空地，由朝廷发给耕牛、农具和种子，或者给钞作兴建屯田之资。但军屯的土地仍归国家所有，而屯军要按规定交纳粮食，作为地租和赋税。
正军从事操练，负防守之责；屯军专事耕种，为军队提供粮食。屯田的士兵，有的就地落户，或全户入屯；有的是单身入屯，定期轮换。屯军与正军的比例一般为每万人，内有两千屯田军，发展到后来，屯田军甚至占一半，而地方各万户府也都拨出一部分军人屯田，并设立千户所管理，或立屯由百户管理，以期多获得些收入。
全国范围的大面积的军屯，对于恢复和发展农业生产，尤其是边疆地区的开发，对于解决庞大军队的供给，发挥了积极的作用。但是由于军屯官吏为从中敛财，便残酷压迫剥削屯军，且这种现象日趋严重，使得备受压迫的征戍军人和军户往往被迫逃亡，有的则出家为僧道，以躲避军役。
伯颜自然也知道巴儿术这样的都万户，已经将这些屯军和土地视为自己的私产，每年从中获得巨额利润。如今让他们放弃嘴里的肉，已不情愿，而自己令他们补充给高丽军，就如同虎口夺食，割他们身上的肉一般，自然是能少给就少给，能不给就不给了。可朝廷不愿出钱，给些废纸一般的宝钞，让他说话也挺不直腰杆儿，不敢多加训斥，以免激起兵变。
如今得不到补给的高丽水军，便自己去想办法了，仗着自身的优势，劫掠商船，凭本事自给自足了。若是平日，倒也罢了，但让伯颜恼火的是他们分不清轻重。按照他的计划，这些高丽水军到达明州后，将搭载着新训练出来的五万水军自淮河出海口进入，然后会同回回水军，沿运河南下攻取镇江后，便可顺运河继续南下，直驱杭州，夺取江东。
但是现在高丽水军被堵在了海上不说，连搭载的水军也跟着在海上漂。可反过来想想，高丽人也是被逼的没法儿了。仅两次东征日本，不仅令高丽先后打造了数千艘战船，预备粮饷，还征发了大批军队随征，已经让其国力大损，民怨沸腾。这次又再次征调，已然国力匮竭的高丽根本再筹措不出粮饷了，才让他们空船而来。
“可否与南朝水军商议一下，让他们尽快退军呢？”这时副都万户秃格插言道。
“怎么商议，他们千里迢迢而来，怎会轻易退军！”巴儿术白了自己的副手一眼道。
“将军，南军不是要我们交出劫掠的财物和杀人越货的海匪，他们便会退军吗？只要将那些高丽人去顶罪便好了！”秃格笑着说道。
“没有那么容易，他们是打着为商船护航的旗