随着计算机技术及计算化学、分子生物学和药物化学的发展，药物设计进入了理性阶段，
计算机辅助药物设计方法（CADD）是药物分子设计的基础，它已经发展成为一门完善和新兴的研究领域，大大提高了药物开发的效率，为人们攻克一些顽症提供了崭新的思路和成功的希望。
它是依据生物化学，酶学，分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果，针对这些基础研究中所揭示的包括酶，受体，离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点，并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征，设计出合理的药物分子。
假以时日，药物设计会进入一个新的发展时期，人类古老的梦想——理论设计好所需物质然后再进行合成的时代正在成为现实！
而在药物合成工艺中，逆合成分析法，是有机合成路线设计的最基本，最常用的方法。
逆合成分析法的突出特征是逆向逻辑思维，从复杂的目标分子推导出简单的起始原料的思维过程，与化学合成的实际过程刚好相反，因此被称为“逆”合成，或“反”合成。
当代有机合成化学大师、哈佛大学E.J.Corey教授于上世纪60年代正式提出了逆合成分析法。而这位正是陈以清在哈佛读博士时候的导师。
逆合成分析的过程可以简单地概括为：以目标分子的结构剖析为基础，将切断，确定合成子，寻找合成等价物三个步骤反复进行，直到找出合适的起始原料。
掌握的化学反应方面的知识越全面，合成路线的设计思路就越开阔。
在设计药物合成工艺路线时，通常希望路线尽量简捷，以最少的反应步骤完成药物分子的构建。但这不能以牺牲药物的质量为代价，必须确保药物的纯度。
这就要求设计者对反应的选择性有充分了解，尽量使用高选择性反应，减少副产物的生成，以获取高质量的产物。
幸运的是，这三位博士都有着丰富的经验，全面渊博的知识，有了现成的药物分子，逆向推导合成方法并不算太难。
一个月后，新的药物终于在实验室里合成了出来。