在夜晚来临之前，智瑜跟娜姿商量，让她先在这里看着刚做完手术的小家伙们。他则是悄悄走了出去。
妙蛙种子看到智瑜一个人离开，偷偷的跟了上去，它以为智瑜是去偷偷捕捉它的同伴的，结果它发现，智瑜来到了它上午偷面包的店，跟老板道歉，付了钱，还祈求了老板的原谅。
“啊！是那个孩子啊！那是个可怜的孩子啊，如果可以。希望你们能够把它带走吧，在这里只会让它更痛苦。看着被抛弃的同伴们，我想它一定会更加不信任人类的吧！”
“老板，你了解它的过去吗？妙蛙种子它们为什么会出现在这里？真的是被抛弃的吗？”
“这个啊，以前呢，妙蛙种子是之前那个镇长家里孩子的宝可梦，可是呢，他嫌弃说这孩子的天赋不好，又不愿意进化，所以在后来搬家的时候，就把这个孩子绑在树上抛弃了。这个孩子啊，就在野外被绑了那么久，差点就没抢救回来，而且，中间它还遇到了那么多被抛弃和虐待的宝可梦，它就更加不亲近人类了。”
“可恶啊，让我找到这帮渣滓，一定要好好教训他们。谢谢你啊，大叔，我就先回去了。”
回到神奇宝贝中心的智瑜满腹心事，他示意妙蛙种子跟他出来。
“妙蛙种子，我知道，我说什么你都不会改变对人类的印象了，但是我还是想要去努力一下！希望你可以能够放下对人类的仇恨，活在阳光下，为自己而活可以吗！”
“种子种子！”
“你是在问我为什么要去替你赔钱道歉吗？没办法啊，我总是觉得这不是你们的错，你们为了活下去，照顾好自己的伙伴，那么作为人类的我，为你们做出些力所能及的小事，有什么问题呢！”
妙蛙种子不在出生，只是默默的回到了病房里。看着躺在病床上的两个小家伙，陷入了沉思。很久以后，它回到了废弃的房屋里，看着瘦弱的大家，妙蛙种子才感觉到自己的弱小。
这时候，智瑜带着娜姿一起，跟妙蛙种子商量，希望可以带着大家一起去体检，检查下大家的身体情况，以防止再出现问题。
妙蛙种子看着害怕的大家伙，安慰着它们，带头向着神奇宝贝中心走去。乔伊小姐为它们检查后，给它们用水冲洗了一下。
然后开了一大堆的钙片，叮嘱智瑜看着它们每天补钙。
虽然，妙蛙种子还在排斥智瑜他们，但是也已经没那么严重了。智瑜不由得感觉到开心，毕竟，这也是一个很大的进步了不是吗！
接下来的时间，智瑜一边照顾着这帮小家伙，一边给它们重新修建小屋。它们大家也会来帮忙，就这样，很快，阿勃梭鲁和火斑喵就可以出院了，看到了崭新的小屋，它们也感觉到非常的开心。
智瑜二人也是得到了这帮小家伙的认可，但是，智瑜他们要走了，不然可能就没办法准时收集完徽章了。
它们只能挥泪跟智瑜二人告别。