等到他第二次出关之时，第二次忍界大战已经开始了。
由于各大国及其忍村的经济差距加大，以追求公平为由，各大国及其忍村的激进派势力抬头，推行以武力来扩大领土的思想。
其中雨隐村沦为各大国的主战场。
木叶在第一次忍界大战中遭遇四大忍村围攻，这些年来休养生息，虽然实力渐渐恢复过来，但因为失去了宇智波斑和千手柱间这样的无敌存在，早已不复当初霸主地位。
在与雨隐村交战的过程中，有着半神之称的山椒鱼半藏通灵释放出大范围的毒物，导致木叶隐村的忍者死伤惨重。
面对这种情况，二代目火影宇智波治里再次尝试联系某人，二十年间第一次得到了回应。