洪熙元年（1701），和硕特汗国安乐汗达赖汗卒，其子拉藏汗，杀兄自袭为汗，并与达赖喇嘛的第巴桑结嘉措不和。
1703年，宣德二年。
藏历新年，拉藏汗乘拉萨举行祈愿大法会之机，指使部下抓住第巴桑结嘉措的几个亲信，加以杀害。
桑结嘉措闻讯，立即纠集自己的兵力，迫使拉藏汗退出拉萨。
拉藏汗退到藏北以后，立马整顿了达木蒙古兵进攻拉萨。
最后，是三大寺的代表，特别是拉藏汗的经师嘉木样协巴出面调解，双方才达成停火协议。
第巴桑结嘉措退位，由他的儿子阿旺仁钦接任第巴，与拉藏汗共同掌管西藏政事。但阿旺仁钦的背后，还是桑结嘉措做主。
五年前（1698），土尔扈特汗国的贤义汗阿玉奇，派他的嫂子和侄儿阿喇布珠尔，率500余人来到西藏熬茶礼佛。
见此情形，阿喇布珠尔一行人知道西藏恐怕要乱。于是借口回国，离开了西藏。
只是没想到，来的时候好好的，回不去了。
就在前两年（1701~1702），阿玉奇的第三子散扎布，因与父不睦，率属户1万余人投奔准噶尔汗国策妄阿拉布坦。
后来，阿玉奇向策妄阿拉布坦追索，散扎布被送归，但其属部1万余人却被扣留，导致土尔扈特汗国与准噶尔汗国关系恶化。
策妄阿拉布坦阻断了土尔扈特汗国通过中亚，前来中国的道路。
阿喇布珠尔一行人被滞留在关西四卫，无法通过准噶尔汗国西返。
朱瞻基早在跟随朱棣，两次出征塞外、参与与蒙古各部的会盟时，就意识到了喇嘛教对于蒙古各部的影响力，也知道喇嘛教发源地——西藏的重要性。
继位后，他便一直关注着西藏局势。
在得知阿喇布珠尔一行人的情况后，立即将他们召到北京来，派人与沙俄交涉后，让他们借道西伯利亚，返回了土尔扈特汗国。
阿喇布珠尔一行人自然对朱瞻基非常感激。
而在他们回国后，也加强了土尔扈特汗国与明朝的联系。
当然，这只是一个插曲。
和阿喇布珠尔一行人预料的一样，西藏的和平没有维持多久，便又爆发了战争。
1705年，宣德四年。
桑结嘉错买通了汗府的内侍，准备毒杀拉藏汗，被拉藏汗发觉。
年初，双方再度爆发军事冲突，仍由三大寺代表和嘉木样协巴调停。
双方表面上再次达成停火协议。但这一次，双方却都没有遵守。
拉藏汗兵分两路南下，第巴桑结嘉措集中十三万户土兵迎击，但却不是蒙古骑兵的对手。
很快，卫藏民兵便被拉藏汗的骑兵击溃，桑结嘉错也被俘，直接在拉萨被拉藏汗处死了。
桑结嘉错死后，他的部下纷纷逃往准噶尔汗国，请求策妄阿拉布坦出兵，帮桑结嘉错报仇。
但策妄阿拉布坦并没有立即出兵。
拉藏汗在处死桑结嘉错之后，又派人到北京，向明廷奏报了捕杀桑结嘉错的原因及经过。
朱瞻基曾亲自参与过对噶尔丹的征讨，知道桑结嘉错勾结准噶尔部、长期匿报五世达赖之死，被杀也是罪有应得。
于是派人进藏，以“天可汗”的名义，封拉藏汗为“恭顺汗”，并赐金印。
事情到这里，还没结束。
拉藏汗还认为，桑结嘉措所立的六世达赖喇嘛仓央嘉措，沉溺酒色，不理教务，不是真正的达赖，请予贬废。
朱瞻基得知后，便让他他把仓央嘉措送到北京。
1706年，宣德五年。
五月初一日，拉藏汗把六世达赖仓央嘉措叫去申斥一顿，数说他的放荡行为。
五月二十七日，拉藏汗将仓央嘉措“诏献京师”。
这个消息在西藏引起了极大震动。
当仓央嘉措被蒙古士兵押解着经过哲蚌寺时，他被一队武装喇嘛抢上了山，并安置在寺内。
蒙古士兵立即包围了该寺，猛攻三天，双方都牺牲很大。
仓央嘉措不忍看到这么多人因自己而死，于是提出下山归队，让蒙古士兵送他去北京，以消弭战火。
押解途中，在行至青海湖滨之时，仓央嘉措坐下打坐，就此圆寂。
宣德六年（1707），拉藏汗重新选定阿旺伊西嘉措为新的六世达赖。
然而，喇嘛教的广大信众却不承认阿旺伊西嘉措的合法性，坚持认为仓央嘉措是六世达赖。
在仓央嘉措死后，喇嘛教各派一致认为，应该寻找他的转世灵童，作为继承人。
宣德七年（1708），青海蒙古各部另选格桑嘉措为七世达赖。
青海和硕特各部首领达什巴图尔，与西藏和硕特汗国拉藏汗结怨，双方爆发了“真假达赖之争”。
这里有一个细节，与原本的历史上不同。
历史上，康熙在收到拉藏汗的奏报后，便全部依照他的意见，废除自己册立的六世达赖喇嘛仓央嘉措，重新册封拉藏汗选定的阿旺伊西嘉措为新的六世达赖喇嘛。
但在这个时空，因为仓央嘉措是由朱棣册封的