不过，民科军事专家其实没有想到，由于赵率教等人坚守不降，他对明廷的敷衍了事，对锦州的见死不救，反而让阿巴海陷入了左右为难的境地。
彼时，后金以军事手段攻击锦州，结果却不能轻易攻克；以政治手段议和，结果赵率教和纪用却虚与委蛇；想诱使锦州守军突围，结果锦州守军死也不挪屁股；想伏击宁远援军，民科军事专家根本就不敢救援。
也就是说，阿巴海的图谋全部落空了，这就让刚刚上位，下面一群人都不服的阿巴海有些坐立不宁了,不得已，阿巴海只好改变思路，正所谓山不就我，我去就山，既然宁远的明军不来救援锦州，锦州守军也不敢轻易突围，那后金就只能主动去进攻宁远了。
天启七年五月二十七日，也就是民科军事专家向北京甩锅的第二天，后金军开始分兵了。
其中一路偏师，继续留守锦州城外，挖掘干壕，包围锦州城，籍此防止锦州守军在关键时候突围，并攻击主力部队的后方。
主力部队则由阿巴海亲自率领，开赴宁远。
五月二十八日，后金兵抵达宁远，民科军事专家仍然是老办法，“凭坚城以用大炮”，想堵门死守，但这次似乎老办法遇到了新问题，宁远城内的人马太多了，光军队就有三万五千人，连民壮不下十万人，城墙上根本站不下，不得已，民科军事专家只得打开向海的东门，派战车营和骑兵出城列队，整整齐齐的队列一直延伸到海边，看起来颇有一番声势。
可后金根本不惧出城作战的明军，阿巴海便明白无误的跟左右说道：“昔皇考太祖攻宁远，不克；今我攻锦州，又未克。似此野战之兵，尚不能胜，其何以张我国威耶！”
言毕，阿巴海亲率贝勒阿济格与诸将、侍卫、护军等向明军冲阵，明军车阵先垮，随后双方骑兵展开对决，战斗从早晨进行到了中午，在满桂和尤世威等两位总兵的带领下，明兵死战不退，后金军伤亡“重大”。
此时，民科军事专家亲临城堞指挥，“凭堞大呼”，并命人从城上发红夷大炮攻打，以至于“后金兵横尸城外，尸填濠堑，后金贝勒济尔哈朗、大贝勒代善第三子萨哈廉和第四子瓦克达俱受重伤”，至午，“奴以其三员骁将受伤，退兵，至双树堡驻营”。
然而诡异的是，明军这边除了满桂和尤世威身负数创以外，辽东将门出身的将军，各个都是毫发无损，而“被受伤”的济尔哈朗等人却没有一点受伤的意识，继续在骑在马上指挥打仗，真正是吹牛不上税啊。
更妙的是，战后民科军事专家上《锦州报捷疏》言称“大战三次三捷，小战二十五日，无日不战”，可战后统计战果，如同宁远一样，斩获后金兵的首级仍然只有两三百而已。
民科军事专家对此辩称是因为后金有“焚烧自方尸体的惯例”，天知道后金兵是如何做到在几万明军和红夷大炮的鼻子下面，把双方上万具搅在一堆的尸体辨认分开，然后从容不迫一具具摆上柴火堆，再花上一两天时间烧掉的。
其实穿帮的还有明军的伤亡数字，击伤后金诸多将领的空前大战后，领饷的兵员却没减少多少，怎么也凑不出“大战三、小战二十五”应有的数千乃至数万的伤亡人数，乃至于真正惨烈的笊篱山之战也就只“伤亡60余人”。
是的，被几万后金军团团围住、明军两员主将都受伤的激战，总共只损失了60多人就冲出来了，明军即便不算高达也是兰博，可这等强兵怎么就没把后金军给消灭或者击败呢？
莫不是，后金军都驾驶着歼星舰来了的？
而就在宁锦大战“如火如荼”之际，毛文龙正带着他的那些如同乞丐的东江兵深入后金老巢赫图阿拉一带大搞“三光政策”起来，而留守的后金军居然学起关宁明军，“据城不出”，任由东江兵大肆掳掠，那是不是说，毛文龙的兵还不止驾驶了歼星舰了？
但不管怎么说，在各种因素的累积下----譬如毛文龙的牵制，譬如天气逐渐炎热，后金军不适应，又譬如，出兵朝鲜的八旗兵在连场大战后的疲惫等等----阿巴海不得不颜面尽失的结束了对宁远和锦州的围攻，撤兵而去。
宁远保住了，锦州保住了，所以，明知道宁锦大捷灌注了九成九的水分，但为了激励军民斗志，明廷还是承认了所谓的胜利，但民科军事专家却是不能留了，所以天启帝给他加了一级官阶后，打发他回老家。
阉党中坚的兵部署部事都察院右副都御史霍维华替他打抱不平，说什么“抚臣袁崇焕置身危疆，六载于兹，老母妻子委为孤注，劳苦功高，应照例荫录······袁崇焕一人止予衔一级······其何以示公而服边吏之心？乞皇上即以畀微臣之世荫，量加一级以还崇焕······俾得以正卿归里”。
可在天启帝看来，民科军事专家问题太多了----谎称用间，其意在谈款，欺君，当斩；派徐敷奏去挖毛文龙墙角，后又抗旨自行宽宥徐敷奏，当斩；在明确知道后金议和是假后，居然放后金使者方今钠等人回去，当斩；不发一兵一卒救援东江和朝鲜，隔岸观火，当斩；说好的战则一城援一城，真开打了，又改口说不能增援，又是欺君，当斩；宁锦之战