在2月初8日夜，李氏朝鲜仁祖陵阳大君纯孝郡王：李倧，连忙带领李氏朝鲜仁穆王太后：金氏，与宗亲百官们仓皇出逃到忠清右道公州牧附近。
次日，在叛军首领：李适，入京后，便拥立李氏朝鲜郡王的叔叔李氏朝鲜兴安大君：李瑅，为新任君主。
2月11日，李氏朝鲜八道都元帅：张晚、李氏朝鲜安州牧使：郑忠信，等将领率八道官军在汉城府西郊的鞍岘洞大破叛军，导致叛军首领：李适，等于深夜被迫撤离汉城府。
翌日，叛军们走到利川都护府时发生内讧，叛军首领：李适、长子：李栴、叛军统领：韩明琏，等人被同党叛军副将：李守白、叛军万户：奇益献，给杀死。
其首级交由李氏朝鲜兵马虞侯：安士诚，被献给朝廷，李适之乱到此结束。
而李氏朝鲜新王兴安大君：李瑅，则在被送返汉阳府的途中，被李氏朝鲜兵曹参判兼汉南都元帅：沈器远，给杀死。
同时大明帝国方面，明戎政兵部左侍郎：朱光祚，奏核练饷节费称“天启元年发练饷三万，天启二年发帑三十万，逾岁费殆二十万，债帅奸徙出入莫问，光祚核银十四万六千二百六十余。勒石贮库。”
2月18日，李氏朝鲜郡王从公州牧返回京畿右道汉城府处理事务。
3月初3日，明都察院山西道监察御史：宋师襄，奏疏道“终日讲筹边务、饬吏治、弭盗贼，而终无成效者，乃因各司议事之后，其实际执行与否皆置之勿问。”
4月11日，水西反贼首领罗甸大王：安邦彦，乘着朝廷大军未集结之际，采取了东进去围困贵州宣慰使司战略要地都匀府（都匀卫），以及清平卫与凯里安抚使司，打算彻底拦截东部明军前进路线。
于是朝廷任命明兵部右侍郎：蔡复一，为〈贵州总镇巡抚〉与明贵州总镇巡按：傅宗龙，一起调遣明湖广川贵总理：鲁钦，奉命率军救援，在汪家冲一带将叛军击败。
紧接着又与明贵州总镇左参将：尹伸，等将领在凯里安抚使司、普定卫（安顺州），等地屡败水西土司叛军。
4月20日，李氏朝鲜郡王从归国使臣那里，获得了大明天子的准封圣旨，代表着宗主国天朝方面的认可。
原本大明群臣都认定其为篡位行为，礼部不予册封，但在李氏朝鲜王国使臣们的恳求，以及驻扎在李氏朝鲜王国境内椵岛（皮岛）的明平辽总兵（东江总镇总兵）兼征虏前将军：毛文龙，的帮助下。
明熹宗也从［联鲜制奴］的战略中考虑，才决定批准册封。
5月初9日，福建都指挥使司福宁卫官兵由于明福宁卫仓大使：林廷柱，盗窃军储，不及时发饷，还与明福宁州知州同知：徐士璋，收受贿赂而不追究。
其中明福宁卫指挥使：王州守，又包庇部下而不为调解。
致使明福宁卫镇抚使：张天锡、明福宁卫百户：王一经，等将领忍无可忍，与众兵卒们一起关闭城门，包围官署，殴打贪吏，树旗拆屋，城门关闭多达十三日。
最终明福建左布政使：朱宋或，亲自前往福宁卫军营勘察并劝解平息事件。
5月21日，朝廷内部党争暗流不断，先有阉党为了庆祝辽东都指挥使司以及登莱两府战事，而选择拉拢明辽东总镇经略：孙承宗，与明登莱巡抚：袁可立，但皆遭到拒绝！
因而被阉党之首明司礼监掌印太监兼东厂提督：魏忠贤，的排挤，故意少发补给、少给钱粮等操作，以及明平辽总兵兼征虏前将军：毛文龙，也倒向了阉党阵营中。
故此登莱两府名义上的主人，明登莱巡抚就显得很尴尬了，为了避免皮岛部联合阉党对自己产生威胁，影响大明战局，因此深明大义的袁巡抚打算即将离任。
不过他恰好在登州府公署中，看到了数年难得一遇的海市蜃楼，遂诗兴大发，在蓬莱阁上留下了千古不朽的名篇《观海市》。
5月29日，明辽东总镇经略：孙承宗，上车营图共计；步骑二十四营，合为车营，外有前锋后勍，骑兵七营，合步骑九万二千八百五十六人，内有步兵四万一千八百五十六人俱足，骑兵五万一千人，现少一万五千七百八十九人，尚议催促各镇兵马，可得万人。
其战马宜六万三千六百一十三匹，今少六千五百八十九匹，拟于京营量选三千五百匹，太仆寺量兑三千一百匹，其各营所需细大之数约七十余万，乞发帑金二十四万两白银，但明熹宗只准发了十万两白银。
此举疑是魏公公批阅奏折？
6月初1日卯时，明都察院左副都御史：杨涟，联合明吏部尚书：赵南星、明大理寺左寺丞：左光斗、明都察院河南道监察御史：袁化中、明吏科都给事中：魏大中、明礼科左给事中：周朝瑞、明刑部山东清吏司郎中：顾大章，等人为首的「东林六君子」联名上奏将写好的奏疏藏在怀里，准备趁着早朝时面奏皇帝陛下，当场揭露九千岁魏公公陷害忠良的事。
但很不巧的是当日免朝，因此